Dicha área pertenece a la Secretaría de Salud y tiene como objetivo controlar la propagación de enfermedades producidas por plagas. También colabora con proteccionistas de animales realizando una gran tarea mancomunada por el bienestar de los animales. Otro de los objetivos de la Dirección es controlar la tasa de natalidad de gatos y perros callejeros realizando castraciones y campañas de concientización sobre la tenencia responsable de mascotas.
En este sentido para aquellos que no tienen los medios económicos para afrontar los costos de castraciones y vacunas antirrábicas, Zoonosis cuenta con dichos servicios a los que se puede acceder solicitando turno en la dependencia de zoonosis o llamando al 478066. Además, personal municipal recorre los barrios con campañas de castración y vacunación.